Gebruik van MLPA bij de diagnostische work-up van B-cel precursor acute lymfoblastische leukemie

Abstract

B-cel precursor acute lymfoblastische leukemie (BCP-ALL) is een kwaadaardige hematologische aandoening waarbij de voorlopers van de B-lymfocyten overmatig prolifereren. Recent werd aangetoond dat verschillende submicroscopische DNA copy-number afwijkingen (CNA''s) een belangrijke rol spelen in de prognose van BCP-ALL-patiënten. Daarom zoekt het Centrum Menselijke Erfelijkheid naar een diagnostische test voor de opsporing van deze afwijkingen.

De MLPA- (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) assay is een betrouwbare, robuuste techniek waarmee gelijktijdig afwijkingen in meerdere targets opgespoord worden. In deze masterproef wordt de SALSA MLPA probemix P335-B1 ALL-IKZF1 van MRC Holland uitgetest voor de opsporing van CNA's bij BCP-ALL. Deze assay detecteert afwijkingen in IKZF1, CDKN2A/B, PAX5, ETV6, BTG1, RB1 en genen van de PAR1-regio (CRLF2, CSF2RA, IL3RA). Na de optimalisatie wordt de assay grondig gevalideerd op juistheid, robuustheid en betrouwbaarheid aan de hand van intra-run en inter-run variabiliteit.

De geteste MLPA-assay blijkt correct, robuust en betrouwbaar en levert zo nuttige informatie omtrent de prognose en kans op therapiefalen bij BCP-ALL. Op basis van deze gegevens wordt de test geïmplementeerd in de diagnostische work-up van deze patiënten.