Schimmelbarcoding en screening van metaaltolerantie in isolaten van Suillus luteus

Abstract

Aan de onderzoeksgroep Milieubiologie van het Centrum voor Milieukunde aan de Universiteit Hasselt wordt de ectomycorrhizaschimmel Suillus luteus bestudeerd voor de ontwikkeling van een fytostabilisatietoepassing voor metaalverontreinigde bodems. Hiervoor zijn er op zowel metaal- als niet-metaalvervuilde bodems schimmels geïsoleerd. Een eerste onderzoeksdoelstelling is schimmelbarcoding om na te gaan of de isolaten weldegelijk S. luteus zijn. Daarnaast moet de zinktolerantie en het zinkfenotype van de isolaten worden bepaald waardoor de isolaten op basis van hun zinktolerantie met elkaar vergeleken kunnen worden en er bovendien geconcludeerd kan worden of bepaalde isolaten al dan niet over een zinktolerantiemechanisme beschikken. De soortbepaling wordt met ITS-PCR uitgevoerd. De zinktolerantie wordt vervolgens nagegaan door de EC50-waarden via dosis-respons experimenten te bepalen. Bij deze dosis-responsexperimenten worden de isolaten blootgesteld aan verschillende zinkconcentraties. De interne zinkconcentratie en dus ook het zinkfenotype wordt tenslotte bepaald via ICP-OES. Uit de soortbepaling kan geconcludeerd worden dat alle geanalyseerde isolaten weldegelijk S. luteus zijn en dus verder gescreend kunnen worden naar hun zinktolerantie en zinkfenotype. Bij 11 andere isolaten zijn de EC50-waarden en de interne zinkconcentraties bepaald. Hieruit kan besloten worden dat 5 isolaten van deze 11 zinktolerantie bezitten en dat al deze zinktolerante isolaten waarschijnlijk in het bezit zijn van een zinkexclusiemechanisme.