Gebruik van gBlocks als positieve ddPCR-controle voor de detectie van therapieresistente mutaties in BCR-ABL1-positieve leukemie

Abstract

Tyrosinekinase-inhibitoren (TKI) vormen een doelgerichte behandeling voor BCR-ABL1-positieve leukemie. Door het ontstaan van puntmutaties in het kinasedomein van het BCR-ABL1-fusiegen kan therapieresistentie optreden. UZ Leuven maakt gebruik van droplet digitale PCR (ddPCR) voor de ABL1-mutatieanalyse.

Commissie Tegemoetkoming Geneesmiddelen keurde recent de terugbetaling van bosutinib (TKI) goed bij afwezigheid van p.V299L- en p.T315I-puntmutaties. Hierdoor is een optimalisatie en validatie nodig van de p.V299L-assay. Elke ddPCR-mutatieanalyse maakt momenteel gebruik van een patiëntenstaal als positieve controle. Omdat dit materiaal eindig is, is het nodig om hiervoor een alternatief te zoeken zoals gBlocks. Deze thesis onderzoekt de manier waarop een juiste gBlock-conditie met een fractional abundance (FA) van 0.5% kan aangemaakt worden als alternatief voor de positieve patiëntencontrole. Momenteel gebeurt voor elke TKI-resistente patiënt een mutatieanalyse met zeven ddPCR-reacties. Door assays te multiplexen, kan de analysetijd en kost gereduceerd worden.

De optimalisatie en validatie van de p.V299L-assay toont aan dat deze puntmutatie opgespoord kan worden met hetzelfde ddPCR-protocol als de overige zes ABL1-assays. De zeven aangemaakte gBlock-verdunningen leveren een FA van 0.5% op en kunnen de huidige positieve patiëntenstalen vervangen. Het multiplexen van de verschillende assays zorgt voor een reductie van zeven naar drie afzonderlijke ddPCR-reacties. Dit resulteert in een daling van de kost en analysetijd.